Expert-comptable pour e-commerce

Shopify, WooCommerce ou marketplaces : un expert-comptable qui rapproche vos encaissements, suit votre stock et déclare la TVA de chaque pays, sans engagement.

  • Vos ventes Stripe, PayPal et marketplaces rapprochées chaque mois, brut et frais séparés
  • TVA par pays et guichet unique OSS suivis dès que vos ventes dans l'UE approchent 10 000 €
  • Stock inventorié, retours comptabilisés : un bilan qui reflète vraiment votre boutique

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En bref

Faut-il un expert-comptable pour un e-commerce ?

Ce n'est pas obligatoire en micro-entreprise, tant que vos ventes restent sous 203 100 € par an. Dès que vous vendez dans l'Union européenne au-delà de 10 000 €, que vous gérez un stock ou que vous passez en société, il devient précieux : TVA par pays, guichet unique OSS, inventaire et bilan. Comptez dès 109 € HT par mois, déductibles.

Par L'équipe E-commerce Pepit · mis à jour le 03/11/2026
Votre métier, nos réflexes

Les 6 points comptables qu'un e-commerçant ne doit pas rater

Déclarer le brut, pas le virement

Votre chiffre d'affaires, c'est le prix payé par le client. Les frais de Stripe, de PayPal et des marketplaces sont des charges, justifiées par leurs relevés : déclarer le net minore vos ventes.

TVA européenne et guichet unique

Au-delà de 10 000 € HT par an de ventes à distance vers des particuliers de l'UE, la TVA du pays du client s'applique. Le guichet unique OSS la déclare en un seul endroit, chaque trimestre.

Importations : IOSS ou TVA à l'import

Vos colis arrivent de Chine ou d'ailleurs ? Les envois de 150 € au plus peuvent passer par l'IOSS. Pour les autres, la TVA à l'import s'autoliquide sur votre déclaration de TVA, collectée et déduite, si vous avez un numéro de TVA français.

Stock, inventaire et retours

En société comme au réel, le stock se valorise à chaque clôture. Les retours et remboursements viennent corriger ventes et TVA : sans avoir, vos marges sont fausses.

Deux seuils à ne pas confondre

Plafond de la micro à 203 100 € de ventes, franchise de TVA à 85 000 € : le second tombe bien avant le premier, et la TVA s'applique alors à toutes vos ventes dès le 1er janvier suivant (ou dès 93 500 €).

DAC7 et facture électronique

Les plateformes déclarent vos ventes à l'administration (DAC7) dès 30 transactions ou plus de 2 000 € par an. Réception des factures électroniques obligatoire depuis septembre 2026, émission et e-reporting B2C à suivre en 2027.

Expert-comptable Amazon : ce que change la vente sur la marketplace ?

Sur Amazon, le virement reçu n'est pas votre chiffre d'affaires. Chaque rapport de paiement mélange ventes brutes, commissions, frais d'expédition FBA, publicité, remboursements aux clients et parfois retenues de réserve. Votre expert-comptable rapproche ces rapports ligne à ligne, pour que vos ventes soient déclarées en brut et chaque frais classé dans la bonne charge.

En FBA, vos stocks sont répartis dans des entrepôts de plusieurs pays. Faire entreposer des marchandises en Allemagne ou en Pologne et y vendre à des clients locaux peut vous obliger à vous immatriculer à la TVA dans ce pays : le guichet unique OSS couvre les ventes à distance entre pays de l'UE, pas ces livraisons locales. En FBM, expédiés depuis la France, ce sont les ventes à distance qui comptent. Le bon schéma se choisit avant de répartir le stock.

Les frais de la place de marché sont souvent facturés par une société établie dans un autre pays de l'UE : la TVA s'autoliquide alors sur ces factures. Amazon transmet aussi vos ventes à l'administration fiscale au titre du DAC7 si vous dépassez les seuils, vos déclarations doivent donc coïncider avec ce qu'il déclare. Un comptable qui connaît la place de marché vous évite l'écart entre vos rapports et votre liasse.

Les missions

Ce que fait un expert-comptable pour un e-commerçant

Une boutique, trois marketplaces ou des ventes dans toute l'Europe : votre expert-comptable s'occupe de tout ce qui n'est pas la vente.

  • Encaissements rapprochésStripe, PayPal, Shopify Payments et marketplaces : ventes brutes, frais et remboursements séparés chaque mois.
  • Achats de marchandises classésFactures fournisseurs, frais de port, emballages, publicité en ligne et abonnements applicatifs.
  • Déclarations de TVACA3 mensuelle ou CA12 annuelle, avec la TVA des ventes en France et celle des importations.
  • Bilan et liasse fiscaleCompte de résultat, annexe, stock de clôture et déclaration de résultat.
  • CFE, IS et acomptesÉchéances suivies et télétransmises, sans relance des impôts.
  • Facturation électroniqueRéception des factures fournisseurs depuis septembre 2026, émission et e-reporting prêts pour 2027.
  • Guichet unique OSSDéclaration trimestrielle de la TVA des ventes à distance vers les autres pays de l'Union européenne.
  • Suivi du seuil de 10 000 €Vos ventes par pays suivies, pour savoir quand la TVA du pays du client prend le relais.
  • Importations et IOSSColis de 150 € au plus sous IOSS, TVA à l'import autoliquidée sur les autres lots.
  • Entrepôts dans plusieurs paysVérification des numéros de TVA locaux quand votre stock est entreposé à l'étranger.
  • DAC7 et marketplacesContrôle de vos ventes déclarées contre le récapitulatif envoyé chaque année par les plateformes.
  • Choix du statutMicro, EI au réel, SASU ou EURL comparés sur vos marges réelles, stock compris.
  • Création de la sociétéStatuts, immatriculation, compte pro : création offerte chez L-Expert-Comptable.com.
  • Passage de la micro à la sociétéPréparé avant que la TVA et le plafond de 203 100 € ne s'imposent, pas subi après.
  • Approbation des comptesAssemblée annuelle et dépôt des comptes au greffe.
  • Marge par produit et par canalCe que rapporte chaque référence, site en propre ou marketplace, frais déduits.
  • Valeur du stockInventaire de clôture et rotation, pour éviter de bloquer votre trésorerie dans le dépôt.
  • Coût d'acquisitionPublicité, commissions et retours rapportés à votre marge, mois par mois.
  • Trésorerie et échéancesLes prochaines sorties d'argent visibles à l'avance : TVA, IS, CFE, réassort.
Tarifs transparents

Combien coûte un expert-comptable pour un e-commerce en 2026 ?

Prix publics HT relevés le 03/11/2026, sans engagement. Répondez à 4 questions : la formule adaptée s'affiche, avec son coût réel une fois déduit.

Votre statut
Vos ventes annuelles estimées ou déjà connues
Vos ventes hors de France
Votre situation comptable
Adaptée à votre situation Micro-entreprise, ventes en France

Logiciel gratuit

avec Tiime

0 € /mois

Options dès 9,99 € HT/mois

  • Factures et devis illimités, conformes
  • Suivi du CA et du plafond de 203 100 €
  • Banque synchronisée (options)
  • Bilan et TVA non inclus

Google 4,7 (985 avis) · Trustpilot 4,6 (620)

Ouvrir mon compte
Adaptée à votre situation Société, EI au réel, ventes dans l'UE

Expert-comptable en ligne

avec L-Expert-Comptable.com

dès 109 € HT/mois

Création de société offerte. Option guichet unique OSS : 50 € HT/mois

  • Comptable dédié, réponse sous 24 h
  • Bilan, liasse fiscale, TVA par pays
  • Rapprochement Stripe, PayPal et marketplaces
  • Conseil statut, stock et ventes en Europe
  • Paie non incluse

Comptabilité seule, la paie n'est pas incluse

Google 4,8 (1 410 avis) · Trustpilot 4,6 (552)

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Par an1 308 € HT
Économie d'impôt− 196 €
Coût réel≈ 1 112 €

Mise en place en une semaine : connexion bancaire, import de vos rapports de paiement Stripe, PayPal et marketplaces.

Pourquoi les e-commerçants choisissent L-Expert-Comptable.com ?

  1. Un comptable dédié qui connaît la vente en ligneStripe, PayPal et marketplaces rapprochés chaque mois.
  2. Un prix fixe, sans engagementDès 109 € HT/mois, bilan, liasse et TVA inclus.
  3. Création de société offerteStatuts et immatriculation de votre SASU ou EURL.
  4. 4,8/5 sur Google1 410 avis vérifiés.
★★★★★
« J’ai choisi L-Expert Comptable pour la prestation d’ouverture de ma société de transport, et je suis ravi de leur avoir confié cette mission grâce à leur réactivité, leurs conseils et leur transparence. Je les remercie »
Nadir A. · société de transportAvis Google · décembre 2025

Outil de gestion facturé à part après 6 mois offerts avec L-Expert-Comptable.com. Option « dépassement du seuil OSS » à 50 € HT/mois en plus. Économie d'impôt estimée : IS à 15 % en société, environ 30 % (impôt et cotisations) en EI.

Avis clients

Expert-comptable e-commerce : les avis de nos clients

E-commerçants, indépendants, sociétés : voici ce que disent de leur expert-comptable les entrepreneurs accompagnés par Pepit.

★★★★★
« Acceuil superbe ! L'accompagnement est royal on sent le côté humain. Les conseillers répondent rapidement a nos demandes et nous conseille de la meilleures manière qui soit. A tous les nouveaux entrepreneurs vous pouvez y aller les yeux fermés. Mentions spéciales a Julie et Marouane pour leur aide précieuse. »
Matthieu · client PepitAvis Trustpilot · juillet 2025
★★★★★
« Un service clair, pro et qui fait passer mon intérêt en premier. »
Yomade · client PepitAvis Trustpilot · avril 2026
★★★★★
« superbe expérience avec ce cabinet, rapidité, disponibilité, réactivité et compétence au top le tout dans un climat cordial et professionel je recommande à tous les futurs créateurs d'entreprise »
François · client PepitAvis Trustpilot · mai 2025
Comment ça se passe

Comment se passe l'accompagnement d'un expert-comptable e-commerce ?

Le bilan n'est qu'une étape. On suit vos canaux de vente, votre stock et les décisions qui changent ce que vous gardez à la fin du mois.

  1. En 15 minutes, par téléphone ou en visio : votre statut, vos ventes, vos canaux, vos pays de livraison et votre stock. Il vous propose la formule adaptée et son prix, sans engagement.

  2. Connexion de votre compte pro, import de vos rapports Stripe, PayPal et marketplaces. Si vous aviez un comptable, on récupère votre dossier auprès de lui.

  3. Ventes brutes, commissions, frais de port et remboursements sont séparés. Vos achats de marchandises et vos dépenses publicitaires sont classés par nature.

  4. TVA en France, déclaration du guichet unique OSS, CFE, impôt sur les sociétés, inventaire de clôture et bilan. Votre comptable vous dit quels justificatifs envoyer avant chaque échéance.

  5. Passer en société, ouvrir une marketplace, stocker dans un entrepôt étranger, vendre dans un nouveau pays : chaque option est simulée, TVA comprise, avant que vous vous lanciez.

Expert-comptable e-commerce : un e-commerçant prépare des colis dans son atelier devant son ordinateur
Illustration

E-commerçant : votre comptabilité mérite un expert qui connaît chaque canal de vente.Premier échange gratuit, sans engagement.

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Faire le bon choix

Tableur, logiciel ou expert-comptable : quelle solution pour la comptabilité de votre e-commerce ?

Chaque option a son vendeur. Tout dépend de votre statut, du nombre de canaux et de votre patience devant un export CSV à 40 000 lignes.

CritèreTout faire sur un tableurUn logiciel seulUn expert-comptable en ligneUn cabinet de proximité
Pour quiMicro, un seul canal, et goût du risque calculéMicro ou EI qui aime garder la mainSociété ou EI au réel, ventes multi-canaux ou multi-paysCeux qui veulent un rendez-vous en face
Budget0 €, payés en nuits d'inventaire0 à 30 € HT/moisForfait mensuel, environ 100 à 250 € HTSelon la lettre de mission
Temps par mois5 à 8 h, plus les nuits avant l'échéance de TVA1 à 3 h30 min pour envoyer vos justificatifs30 min, plus les rendez-vous
Stripe, PayPal et marketplacesFusionnés à la main dans un onglet qui planteImportés, à vérifier vous-mêmeRapprochés par votre comptableRapprochés par votre comptable
TVA par pays et guichet unique OSSÀ vous de connaître chaque taux et chaque paysCalcul aidé, à vous de déclarerDéclarée pour vousDéclarée pour vous
Bilan, liasse et stock de clôture (société)NonPréparés, sans validation d'un expertInclusInclus
Conseil statut, stock et ventes à l'étrangerL'ami qui a « vendu sur Vinted »NonOui, au téléphone ou en visioOui, au cabinet
Le moment de solitudeLe fichier qui ne s'ouvre plus le jour de la déclaration de TVALa question que l'aide en ligne n'a pas prévueRare : un interlocuteur répond sous 24 hRare : un interlocuteur que vous connaissez

Fourchettes de prix et de temps indicatives, relevées en novembre 2026. Aucune marque citée.

Près de chez vous

Vous préférez un expert-comptable e-commerce près de chez vous ?

Entrez votre adresse pour voir les cabinets d'expertise comptable de votre quartier. Vous pouvez aussi être accompagné à distance par un conseiller qui connaît les boutiques en ligne.

Entrez votre adresse pour voir les cabinets les plus proches.

    Cabinets : base Sirene (API Recherche d'entreprises), code NAF 69.20Z, moins de 20 salariés, hors grands groupes.

    Les questions fréquentes sur la comptabilité d'un e-commerce

    Combien coûte un expert-comptable pour un e-commerçant ?

    Chez L-Expert-Comptable.com, l'offre commerçants démarre à 109 € HT par mois, bilan, liasse et TVA compris. L'option « dépassement du seuil OSS » du guichet unique européen ajoute 50 € HT par mois. Le prix final dépend de votre volume d'activité. Les honoraires sont déductibles.

    Un expert-comptable est-il obligatoire pour un e-commerçant ?

    Non, aucun statut ne l'impose. En micro-entreprise, un livre des recettes et un registre des achats suffisent. En société ou en EI au réel, vous devez produire un bilan, un compte de résultat et une liasse fiscale chaque année, d'où l'intérêt d'un comptable qui connaît le stock et la TVA européenne.

    Quel est le plafond de la micro-entreprise pour un e-commerçant ?

    Le plafond de la micro-entreprise est de 203 100 € de ventes en 2026. La franchise en base de TVA est plus basse : 85 000 € l'année précédente, ou 93 500 € l'année en cours. Au-delà, la TVA s'applique à toutes vos ventes, dès le 1er janvier suivant ou dès le dépassement de 93 500 €.

    Faut-il facturer la TVA d'un autre pays de l'UE ?

    Oui, au-delà de 10 000 € de ventes à distance par an vers des particuliers de l'UE, hors taxes. Vous appliquez alors le taux du pays du client, et vous le déclarez via le guichet unique OSS. Sous ce seuil, vous pouvez rester à la TVA française, ou opter pour celle du pays de destination.

    Qu'est-ce que le guichet unique OSS pour un e-commerçant ?

    C'est un service de impots.gouv.fr où vous déclarez et payez, en une seule fois par trimestre, la TVA due dans tous les pays de l'UE où vous vendez à des particuliers. Il vous évite de vous immatriculer à la TVA dans chaque pays. L'IOSS, son équivalent mensuel, concerne les colis importés de 150 € au plus.

    Faut-il déclarer le virement Stripe ou le prix payé par le client ?

    Le prix payé par le client, frais de port facturés compris. Les frais de Stripe, PayPal ou de la marketplace sont des charges, justifiées par leurs relevés. Déclarer le virement net minore votre chiffre d'affaires et fausse le suivi du plafond de la micro comme de la franchise de TVA.

    Comment est comptabilisé le stock d'un e-commerçant ?

    En société comme en EI au réel, vos achats de marchandises sont enregistrés à leur coût d'achat, puis le stock restant est valorisé par un inventaire à chaque clôture. La variation de stock corrige le résultat. En micro-entreprise, il n'y a pas d'inventaire comptable : un registre des achats suffit.

    Comment comptabiliser les retours et remboursements clients ?

    Chaque remboursement se traduit par un avoir qui vient réduire le chiffre d'affaires et la TVA collectée de la période. Le produit retourné revient en stock s'il est revendable, ou en perte sinon. Un retour de commande d'un autre pays de l'UE corrige aussi la déclaration OSS.

    Qu'est-ce que la déclaration DAC7 pour un vendeur de marketplace ?

    Dès 30 transactions ou plus de 2 000 € de ventes sur l'année, les plateformes déclarent vos ventes à l'administration fiscale et vous envoient un récapitulatif avant le 31 janvier. L'administration connaît donc votre chiffre d'affaires brut par plateforme : vos déclarations doivent coïncider, sinon vous risquez une demande d'explications.

    Que change la facturation électronique pour un e-commerçant ?

    Depuis le 1er septembre 2026, vous devez pouvoir recevoir les factures électroniques de vos fournisseurs. L'émission devient obligatoire en septembre 2027 pour les micro-entreprises, TPE et PME, avec l'e-reporting de vos ventes aux particuliers. Votre comptable choisit avec vous la plateforme agréée adaptée à votre boutique.

    Quand passer de la micro-entreprise à la société pour une boutique en ligne ?

    Quand vos ventes approchent 85 000 € (TVA), quand le stock immobilise de la trésorerie, ou quand vos charges réelles dépassent l'abattement forfaitaire de la micro (71 % en vente de marchandises). Mieux vaut la préparer avant le plafond de 203 100 €.

    Peut-on changer d'expert-comptable en cours d'année quand on vend en ligne ?

    Oui. Le plus simple est de changer en fin d'exercice, mais une reprise en cours d'année est possible : le nouveau cabinet récupère le dossier de l'ancien et vos rapports de paiement. Sans engagement, vous ne payez aucune pénalité de sortie chez L-Expert-Comptable.com.

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    Un conseiller vous rappelle, fait le point sur votre situation et vous propose la formule adaptée. Votre expert-comptable prend ensuite le relais.

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