Comparatif + simulateur 2026

Logiciel comptable TPE : lequel choisir quand l'entreprise embauche ?

Mis à jour le

Premier salarié, assistante qui saisit les factures, expert-comptable qui contrôle : dès que l'équipe s'agrandit, le logiciel doit suivre. Répondez à 5 questions, on vous dit lequel prendre et combien il vous coûtera sur un an.

Quel logiciel pour votre TPE ?

Votre statutLe critère qui élimine le plus de solutions
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  • Aucune coordonnée demandée
  • ✓6 000 entrepreneurs accompagnés par nos experts-comptables depuis 15 ans.
  • →8 solutions analysées sur les besoins réels d'une TPE : paie, multi-utilisateurs, trésorerie, TVA.
  • €Tarifs relevés sur les sites éditeurs, offre d'entrée, hors promotions.
  • ★Méthode de notation publique, détaillée en bas de page.
L-Expert-Comptable.comTiimeSwapnFreebeAxonautSellsyEvolizHenrri
P Par L'équipe Pepit · Comparatif établi à partir des sites des éditeurs et des données publiques (INSEE, URSSAF).

Vos 3 solutions recommandées

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Notre sélection selon votre profil de dirigeant de TPE

Il n'y a pas de meilleur logiciel dans l'absolu : tout dépend du nombre de salariés, de la forme juridique et de la part de comptabilité que vous voulez garder en interne.

Meilleur pour garder du temps

Artisan qui embauche son premier salarié

Dirigeant + 1 salarié · bulletins mensuels

Votre CA
20 000 à 50 000 €
Budget
69 €/mois828 € HT par an
Compatibilité
—

Comptabilité, TVA et bilan sont confiés à un comptable dédié, ce qui libère du temps pour gérer l'embauche.

Limite : Bulletins de salaire non inclus : à confier à un prestataire spécialisé.

L-Expert-Comptable.comdès 69 € HT/mois
4,4
Voir L-Expert-Comptable.com →
Meilleur pour le suivi de trésorerie

Commerce avec stock

Société (SARL, SAS) · achats, ventes, TVA à plusieurs taux

Votre CA
20 000 à 50 000 €
Budget
29 €/mois348 € HT par an
Compatibilité
—

Les comptables cadrent la TVA et le bilan, et le suivi bancaire donne une vision de la trésorerie.

Limite : EI au réel BIC non prise en charge ; la gestion du stock dépend d'un outil de caisse ou de gestion à côté.

Swapndès 29 € HT/mois
4,3
Voir Swapn →
Meilleur pour une équipe

Agence de services à 5 salariés

Facturation récurrente, relances clients, assistante administrative

Votre CA
20 000 à 50 000 €
Budget
29 €/mois348 € HT par an
Compatibilité
—

Plusieurs accès, devis, factures et relances au même endroit, avec un bilan et une liasse certifiés par un expert-comptable.

Limite : Paie des salariés uniquement via un partenaire, en option.

Swapndès 29 € HT/mois
4,3
Voir Swapn →
Meilleur pour tout déléguer

TPE qui veut tout déléguer

Dirigeant sur le terrain, peu de temps pour la compta

Votre CA
20 000 à 50 000 €
Budget
69 €/mois828 € HT par an
Compatibilité
—

Comptabilité et TVA prises en charge, avec un comptable dédié et des conseils fiscaux et juridiques personnalisés.

Limite : Moins de maîtrise au quotidien si vous aimez saisir vous-même.

L-Expert-Comptable.comdès 69 € HT/mois
4,4
Voir L-Expert-Comptable.com →

Comparatif complet des logiciels comptables pour TPE

SolutionStatutsNote PepitAvisPrix d'entréeMulti-utilisateursInclusAccompagnementAction
N°1
L-Expert-Comptable.comCabinet en ligne
MicroEI réelEURL/SARLSASU/SAS
4,4 dès 69 € HT/mois —
BilanLiasseTVAConseil fiscal
Comptable dédié (24 h) Voir →
N°2
TiimeLogiciel de gestion
MicroEI réelEURL/SARLSASU/SAS
4,4 Gratuit —
FacturationDevisBanque
Support (tél., mail, chat) Voir →
N°3
SwapnComptabilité en ligne + appli
MicroEI réelEURL/SARLSASU/SAS
4,3 dès 29 € HT/mois —
BilanLiasseTVAFacturation
Équipe comptable (24 h) Voir →
FreebeLogiciel de facturation
MicroEI réelEURL/SARLSASU/SAS
4,2
★ 4,6 Trustpilot (28 avis)relevé le 06/10/2026
12,50 €/mois TTC en annuel —
FacturationDevisBanqueTemps passé
Logiciel seul Voir →
AxonautLogiciel métier
Non précisé
4,2 À vérifier ✓ Oui
FacturationDevisBanquePlateformes
Logiciel seul Voir →
SellsyLogiciel de facturation
Non précisé
4,2 dès 29 € HT/mois ✓ Oui
FacturationDevisBanqueMulti-utilisateurs
Logiciel seul Voir →
EvolizLogiciel de gestion
MicroEI réelEURL/SARLSASU/SAS
4,2 À vérifier —
FacturationTVA
Support en ligne Voir →
HenrriLogiciel de facturation
MicroEI réelEURL/SARLSASU/SAS
4,1
★ 4,1 Trustpilot (405 avis)relevé le 06/10/2026
Gratuit ✓ Oui
FacturationDevisNotes de frais
Logiciel seul Voir →

Tarifs relevés le 05/10/2026 sur les sites éditeurs (offre d'entrée, HT). Note Pepit /5 : voir « Comment nous notons ».

Quel logiciel comptable pour une TPE ?

La réponse courte Une TPE emploie moins de 10 salariés, et son logiciel doit gérer ce qu'un indépendant seul ignore : paie, plusieurs utilisateurs, suivi de trésorerie, relances clients. Sans salarié, un outil gratuit peut suffire pour la saisie. Dès le premier salarié, un cabinet en ligne ou un expert-comptable évite les erreurs de paie et de déclaration.

« TPE » désigne la taille de l'entreprise, pas sa forme juridique : vous pouvez être en entreprise individuelle, EURL, SARL ou SAS. Selon l'Insee, une très petite entreprise emploie moins de 10 personnes et reste sous un plafond de chiffre d'affaires ou de bilan. Le logiciel dépend donc moins du statut que de l'organisation : qui saisit, qui paie, qui contrôle.

Les fiches détaillées

Cabinet en ligne
4,4

dès 69 € HT/mois, sans engagement

Idéal pour : TPE qui veut déléguer comptabilité, TVA et conseils fiscaux

Points forts

  • Comptable dédié, réponse sous 24 h
  • Conseils fiscaux et juridiques personnalisés
  • Sans engagement, création d'entreprise offerte

Limites

  • Micro-entreprise non éligible
  • Outil de gestion partenaire facturé à part après 6 mois offerts
  • Plus cher qu'un outil seul
Découvrir L-Expert-Comptable.com →
Logiciel de gestion
4,4

Gratuit (Free) ; options dès 9,99 € HT/mois

Idéal pour : TPE sans salarié ou avec une comptabilité simple, faite en interne

Points forts

  • Offre gratuite : facturation électronique (plateforme agréée), devis et factures illimités
  • Banque synchronisée et justificatifs automatiques (offres payantes)
  • Support humain par téléphone, mail et chat

Limites

  • Bilan, liasse et déclarations à confier à un expert-comptable
  • Compte pro obligatoire sur les offres payantes
  • Bilan et liasse à faire faire à part
Découvrir Tiime →
Comptabilité en ligne + appli
4,3

dès 29 € HT/mois, sans engagement

Idéal pour : TPE sous forme de société qui veut des comptables à petit prix et garde la main sur le quotidien

Points forts

  • Bilan et liasse certifiés par un expert-comptable
  • Comptables joignables sous 24 h (tél., visio, chat, e-mail)
  • Sans engagement, facturation électronique conforme

Limites

  • Micro-entreprise non prise en charge
  • Outil de gestion partenaire facturé à part après 6 mois offerts
  • EI au réel : régime BNC uniquement
Découvrir Swapn →

Freebe

Logiciel de facturation
4,2

12,50 €/mois TTC en annuel (150 € TTC/an), 30 jours offerts

★ 4,6 Trustpilot (28 avis)relevé le 06/10/2026

Idéal pour : Freelances voulant facturer et suivre leur trésorerie simplement

Points forts

  • Tarif unique tout inclus, 30 jours d'essai sans CB
  • Synchro de plus de 450 banques
  • Déclaration URSSAF automatique pour micro

Limites

  • Pas d'expert-comptable inclus
  • Prix publié en TTC
Découvrir Freebe →
Logiciel métier
4,2

À vérifier

Idéal pour : TPE/PME voulant un logiciel de gestion tout-en-un

Points forts

  • Factures et devis illimités
  • Compte pro avec IBAN et carte Mastercard
  • Compte non-engagé, essai 15 jours

Limites

  • Prix par utilisateur supplémentaire
  • Pas d'expert-comptable inclus
Découvrir Axonaut →

Sellsy

Logiciel de facturation
4,2

dès 29 €/mois (Facturation Standard, 2 licences minimum)

Idéal pour : TPE/PME voulant CRM et facturation électronique réunis

Points forts

  • Plateforme de facturation électronique agréée
  • Hébergement en France, ISO 27001
  • Essai 15 jours sans CB

Limites

  • Minimum 2 licences
  • Pré-comptabilité seulement, pas de comptabilité complète
Découvrir Sellsy →

Henrri

Logiciel de facturation
4,1

Offre Pro gratuite ; Expert 17,19 €/mois HT

★ 4,1 Trustpilot (405 avis)relevé le 06/10/2026

Idéal pour : Micro et TPE voulant facturer sans payer

Points forts

  • Gratuit et illimité
  • Facturation électronique conforme 2026
  • Utilisateurs illimités

Limites

  • Pas de comptabilité complète annoncée
  • Pas d'expert-comptable inclus
Découvrir Henrri →

Les fonctionnalités d'un logiciel comptable pour TPE

Une TPE cumule les obligations d'une société et celles d'un employeur. Voici les fonctionnalités à vérifier, et celles qui deviennent indispensables à mesure que l'équipe grandit.

Paie, DSN et premier salarié

Embaucher impose d'établir un bulletin de paie chaque mois et de transmettre la déclaration sociale nominative (DSN). Selon l'outil, la paie est incluse, en option ou à confier à un prestataire. Pour un premier salarié, un accompagnement humain évite les erreurs sur le contrat, les cotisations et les congés.

Gestion multi-utilisateurs

Le dirigeant, une assistante et l'expert-comptable doivent travailler sur le même dossier avec des droits différents : saisie, validation, consultation. Un logiciel limité à un seul accès oblige à échanger des fichiers par mail, source d'erreurs et de doublons.

Suivi de trésorerie et relances clients

La synchronisation bancaire alimente un tableau de bord de trésorerie : encaissements attendus, charges à venir, solde prévisionnel. Les relances de factures impayées se programment depuis le logiciel. Pour une TPE, un retard de paiement pèse vite sur la trésorerie.

Devis et factures conformes

Le devis se transforme en facture sans ressaisie, avec les mentions obligatoires et une numérotation continue. Les acomptes, les avoirs et la TVA à plusieurs taux doivent être gérés. C'est le point où un outil de facturation spécialisé fait gagner du temps.

Stock et achats

Si vous revendez des marchandises, la comptabilité doit suivre les achats et la variation de stock à la clôture. Peu de logiciels comptables gèrent un stock détaillé : il se tient souvent dans un outil de caisse ou de gestion relié à la comptabilité.

TVA et déclarations

Le logiciel calcule la TVA collectée et déductible de la période et prépare la déclaration, mensuelle, trimestrielle ou annuelle selon votre régime. Les erreurs de TVA figurent parmi les premières causes de redressement.

Notes de frais

Plus il y a de personnes qui avancent des frais, plus le rapprochement manuel pèse. Une application mobile qui photographie le justificatif et l'associe à l'opération évite la saisie de fin de mois.

Facture électronique 2026-2027

Selon le calendrier officiel, toutes les entreprises assujetties à la TVA doivent pouvoir recevoir des factures électroniques depuis le 1er septembre 2026, et les PME et TPE devront en émettre à compter du 1er septembre 2027, via une plateforme agréée. Vérifiez que votre éditeur a prévu ce raccordement.

Bilan, liasse et dépôt des comptes

Une société établit chaque année un bilan, un compte de résultat et une liasse fiscale, puis dépose ses comptes selon sa forme juridique. Un entrepreneur individuel a d'autres obligations déclaratives. Un cabinet en ligne s'en charge souvent ; avec un logiciel seul, ces formalités restent à votre charge.

Les fonctionnalités d'un logiciel comptable pour TPE, selon la situation
FonctionnalitéSans salarié1 à 3 salariés4 à 9 salariés
Devis et factures conformes IndispensableIndispensableIndispensable
Synchronisation bancaire IndispensableIndispensableIndispensable
TVA et déclarations Indispensablesauf franchise en baseIndispensableIndispensable
Bilan et liasse fiscale IndispensableIndispensableIndispensable
Paie des salariés et DSN —IndispensableIndispensable
Accès multi-utilisateurs UtileIndispensableIndispensable
Suivi de trésorerie et relances UtileUtileIndispensable
Notes de frais UtileUtileIndispensable
Gestion de stock UtileUtileUtile
Facture électronique (plateforme agréée) IndispensableIndispensableIndispensable

Forme juridique, employeur, impôt : ce que ça change pour le logiciel

Une TPE peut être exploitée en entreprise individuelle, en EURL, en SARL, en SAS ou sous une autre forme. L'impôt (impôt sur le revenu ou impôt sur les sociétés) et le régime social du dirigeant en dépendent, mais pas l'obligation de tenir une comptabilité : hors micro-régime, elle est tenue selon le régime réel.

L'arrivée du premier salarié change la nature du travail administratif : contrat, bulletins de paie mensuels, DSN, suivi des congés et des absences. Le dirigeant devient employeur, avec des déclarations régulières et des délais à respecter. C'est le moment où beaucoup de TPE basculent d'un logiciel seul vers un cabinet qui prend la paie en charge.

Avec le temps, le rôle de l'expert-comptable évolue : il ne se limite plus au bilan, il aide à piloter la trésorerie, à anticiper la TVA et à préparer les décisions de gestion. Le logiciel sert à produire des chiffres fiables en cours d'année, partagés entre le dirigeant, l'assistante et l'expert.

3 TPE, 3 choix différents

Des profils types, avec des montants annuels estimés.

TPE sans salarié

Karim, plombier

Dirigeant seul · devis et factures
CA annuel
90 000 €
Temps compta / mois
~3 h
Budget outil
0 €
Son choix : un outil gratuit pour les devis, les factures et la banque, avec un expert ponctuel pour le bilan. Pas de paie à produire.
TPE avec 1 salarié

Sophie, boulangère

1 salarié · TVA à plusieurs taux
CA annuel
300 000 €
Bulletins de paie
12 par an
Budget
~80 €/mois
Son choix : un cabinet en ligne avec paie incluse : l'expert cadre le premier bulletin, la TVA et le bilan. L'outil de caisse alimente la comptabilité.
TPE de 5 salariés

Thomas, agence de communication

5 salariés · assistante · facturation récurrente
CA annuel
600 000 €
Obligations
Bilan, paie, TVA
Budget
~200 €/mois
Son choix : un cabinet avec paie et accès multi-utilisateurs : l'assistante saisit, l'expert contrôle, le dirigeant suit la trésorerie.

Combien coûte un logiciel comptable pour une TPE ?

Les prix vont de zéro à plusieurs centaines d'euros par mois, mais ils ne recouvrent pas le même service. Trois familles se distinguent.

  • Gratuit : des outils de facturation et de suivi bancaire, suffisants sans salarié. La paie, le bilan et la liasse fiscale sont à faire établir à part.
  • De 10 à 40 € par mois : des logiciels comptables complets ou des cabinets en ligne d'entrée de gamme. Vérifiez ce que contient l'offre : paie, nombre d'utilisateurs, bilan et liasse sont parfois en option.
  • À partir de 40 € HT par mois : un cabinet d'expertise comptable en ligne, logiciel compris. Le tarif augmente avec le nombre de salariés, de bulletins de paie et d'opérations.

Pour comparer, raisonnez sur douze mois et sur le service complet : un logiciel peu cher auquel s'ajoutent la paie, le bilan et la liasse en prestations séparées peut revenir plus cher qu'un cabinet en ligne qui les inclut. Le simulateur en haut de page calcule ce coût annuel pour votre situation.

Logiciel comptable seul ou expert-comptable en ligne ?

Pour une TPE, la bonne formule évolue avec l'entreprise : le premier salarié et la croissance de la facturation déplacent souvent la frontière.

Logiciel comptable seul

  • Sans salarié
  • Peu d'opérations
  • À l'aise avec la TVA et la liasse

Pour démarrer, un logiciel gratuit ou peu cher suffit si vous tenez vous-même la comptabilité. Tiime en est un exemple.

Logiciel + expert ponctuel

  • Saisie faite par vous ou l'assistante
  • Expert pour le bilan et la liasse
  • Conseil à la demande

Une formule intermédiaire : vous tenez la comptabilité, un expert valide et signe les comptes.

Expert-comptable en ligne

  • Un ou plusieurs salariés
  • Bilan, liasse et paie pris en charge
  • Plusieurs utilisateurs

Un expert-comptable en ligne prend en charge la comptabilité de bout en bout, avec un outil de gestion partenaire (6 mois offerts, puis facturé à part).

Les 6 critères pour bien choisir

  1. La paie des salariés. Incluse, en option ou à faire ailleurs : le premier point à vérifier dès l'embauche.
  2. Le nombre d'utilisateurs. Dirigeant, assistante et expert doivent pouvoir accéder au dossier avec des droits adaptés.
  3. Le suivi de trésorerie. Tableau de bord et relances clients pour anticiper les tensions de trésorerie.
  4. La TVA et la facture électronique. Calcul, déclaration et plateforme agréée pour 2026-2027.
  5. Le prix sur 12 mois. Regardez le prix hors promotion et les options (paie, bilan, liasse, utilisateurs).
  6. L'accompagnement. Un humain joignable au moment de la paie ou de la clôture change tout.

La checklist comptable mensuelle du dirigeant de TPE

  • Rapprocher les opérations bancaires et classer chaque dépense
  • Établir les bulletins de paie et transmettre la DSN
  • Vérifier la TVA collectée et déductible de la période
  • Relancer les factures clients impayées
  • Contrôler la trésorerie prévisionnelle des trois prochains mois

Questions fréquentes

Quel logiciel comptable choisir pour une TPE ?

Sans salarié, un outil gratuit suffit pour la saisie, complété par un expert pour le bilan. Dès le premier salarié, un cabinet en ligne avec paie incluse est plus sûr. Le critère décisif est le nombre d'utilisateurs et la gestion de la paie, plus que le prix affiché. Le simulateur ci-dessus classe les solutions.

Qu'est-ce qu'une TPE exactement ?

Selon l'Insee, une très petite entreprise emploie moins de 10 personnes et reste sous un plafond de chiffre d'affaires ou de total de bilan. Ce n'est pas une forme juridique : une TPE peut être une entreprise individuelle, une EURL, une SARL ou une SAS. Le seuil sert aux statistiques et à certaines aides.

Quel logiciel pour établir la paie de mon premier salarié ?

Choisissez un outil ou un cabinet qui inclut la paie et la déclaration sociale nominative. Pour un premier salarié, un accompagnement humain réduit le risque d'erreur sur le contrat, les cotisations et les congés. Vérifiez si la paie est comprise dans l'abonnement ou facturée par bulletin avant de vous engager.

Une TPE est-elle obligée d'avoir un expert-comptable ?

Non, la loi ne l'impose pas. Mais une société doit tenir une comptabilité d'engagement, établir un bilan et une liasse fiscale. Beaucoup de dirigeants en confient la production à un expert, surtout avec des salariés. Comparez le coût d'un abonnement avec celui d'un bilan et d'une paie facturés séparément.

La facture électronique concerne-t-elle les TPE ?

Oui. Selon le calendrier officiel, toutes les entreprises assujetties à la TVA doivent pouvoir recevoir des factures électroniques depuis le 1er septembre 2026. Les PME et TPE devront en émettre à partir du 1er septembre 2027, via une plateforme agréée. Demandez à votre éditeur s'il est prêt.

Quand passer d'un logiciel seul à un expert-comptable ?

Plusieurs signaux : premier salarié, TVA complexe, forte hausse du nombre de factures, besoin de prévisions de trésorerie ou de conseil fiscal. Si la comptabilité vous prend plus de quelques heures par semaine, déléguer devient rentable. Un cabinet en ligne permet de garder le logiciel tout en ajoutant l'expert.

Comment nous notons

La note Pepit /5 est une note éditoriale fondée sur 5 critères pondérés selon le métier : statuts couverts, automatisations propres au métier, gestion fiscale, prix sur 12 mois et accompagnement. Elle reflète l'adéquation à votre situation, pas la qualité générale d'un éditeur : un outil moins bien noté ici peut être excellent pour un autre profil. Les tarifs sont relevés sur les sites des éditeurs et mis à jour chaque trimestre ; les avis Google et Trustpilot sont affichés tels quels, avec leur date de relevé.

Sources : service-public.fr, impots.gouv.fr, economie.gouv.fr (facture électronique), insee.fr (définition des TPE), sites éditeurs.

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