Quel logiciel comptable pour une TPE ?
La réponse courte Une TPE emploie moins de 10 salariés, et son logiciel doit gérer ce qu'un indépendant seul ignore : paie, plusieurs utilisateurs, suivi de trésorerie, relances clients. Sans salarié, un outil gratuit peut suffire pour la saisie. Dès le premier salarié, un cabinet en ligne ou un expert-comptable évite les erreurs de paie et de déclaration.
« TPE » désigne la taille de l'entreprise, pas sa forme juridique : vous pouvez être en entreprise individuelle, EURL, SARL ou SAS. Selon l'Insee, une très petite entreprise emploie moins de 10 personnes et reste sous un plafond de chiffre d'affaires ou de bilan. Le logiciel dépend donc moins du statut que de l'organisation : qui saisit, qui paie, qui contrôle.
Les fiches détaillées
L-Expert-Comptable.com
Cabinet en ligne 4,4
dès 69 € HT/mois, sans engagement
Idéal pour : TPE qui veut déléguer comptabilité, TVA et conseils fiscaux
Points forts
- Comptable dédié, réponse sous 24 h
- Conseils fiscaux et juridiques personnalisés
- Sans engagement, création d'entreprise offerte
Limites
- Micro-entreprise non éligible
- Outil de gestion partenaire facturé à part après 6 mois offerts
- Plus cher qu'un outil seul
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Tiime
Logiciel de gestion 4,4
Gratuit (Free) ; options dès 9,99 € HT/mois
Idéal pour : TPE sans salarié ou avec une comptabilité simple, faite en interne
Points forts
- Offre gratuite : facturation électronique (plateforme agréée), devis et factures illimités
- Banque synchronisée et justificatifs automatiques (offres payantes)
- Support humain par téléphone, mail et chat
Limites
- Bilan, liasse et déclarations à confier à un expert-comptable
- Compte pro obligatoire sur les offres payantes
- Bilan et liasse à faire faire à part
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Swapn
Comptabilité en ligne + appli 4,3
dès 29 € HT/mois, sans engagement
Idéal pour : TPE sous forme de société qui veut des comptables à petit prix et garde la main sur le quotidien
Points forts
- Bilan et liasse certifiés par un expert-comptable
- Comptables joignables sous 24 h (tél., visio, chat, e-mail)
- Sans engagement, facturation électronique conforme
Limites
- Micro-entreprise non prise en charge
- Outil de gestion partenaire facturé à part après 6 mois offerts
- EI au réel : régime BNC uniquement
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Freebe
Logiciel de facturation4,2
12,50 €/mois TTC en annuel (150 € TTC/an), 30 jours offerts
Idéal pour : Freelances voulant facturer et suivre leur trésorerie simplement
Points forts
- Tarif unique tout inclus, 30 jours d'essai sans CB
- Synchro de plus de 450 banques
- Déclaration URSSAF automatique pour micro
Limites
- Pas d'expert-comptable inclus
- Prix publié en TTC
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Axonaut
Logiciel métier 4,2
À vérifier
Idéal pour : TPE/PME voulant un logiciel de gestion tout-en-un
Points forts
- Factures et devis illimités
- Compte pro avec IBAN et carte Mastercard
- Compte non-engagé, essai 15 jours
Limites
- Prix par utilisateur supplémentaire
- Pas d'expert-comptable inclus
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Sellsy
Logiciel de facturation4,2
dès 29 €/mois (Facturation Standard, 2 licences minimum)
Idéal pour : TPE/PME voulant CRM et facturation électronique réunis
Points forts
- Plateforme de facturation électronique agréée
- Hébergement en France, ISO 27001
- Essai 15 jours sans CB
Limites
- Minimum 2 licences
- Pré-comptabilité seulement, pas de comptabilité complète
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Evoliz
Logiciel de gestion 4,2
À vérifier
Idéal pour :
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Henrri
Logiciel de facturation4,1
Offre Pro gratuite ; Expert 17,19 €/mois HT
Idéal pour : Micro et TPE voulant facturer sans payer
Points forts
- Gratuit et illimité
- Facturation électronique conforme 2026
- Utilisateurs illimités
Limites
- Pas de comptabilité complète annoncée
- Pas d'expert-comptable inclus
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Les fonctionnalités d'un logiciel comptable pour TPE
Une TPE cumule les obligations d'une société et celles d'un employeur. Voici les fonctionnalités à vérifier, et celles qui deviennent indispensables à mesure que l'équipe grandit.
Paie, DSN et premier salarié
Embaucher impose d'établir un bulletin de paie chaque mois et de transmettre la déclaration sociale nominative (DSN). Selon l'outil, la paie est incluse, en option ou à confier à un prestataire. Pour un premier salarié, un accompagnement humain évite les erreurs sur le contrat, les cotisations et les congés.
Gestion multi-utilisateurs
Le dirigeant, une assistante et l'expert-comptable doivent travailler sur le même dossier avec des droits différents : saisie, validation, consultation. Un logiciel limité à un seul accès oblige à échanger des fichiers par mail, source d'erreurs et de doublons.
Suivi de trésorerie et relances clients
La synchronisation bancaire alimente un tableau de bord de trésorerie : encaissements attendus, charges à venir, solde prévisionnel. Les relances de factures impayées se programment depuis le logiciel. Pour une TPE, un retard de paiement pèse vite sur la trésorerie.
Devis et factures conformes
Le devis se transforme en facture sans ressaisie, avec les mentions obligatoires et une numérotation continue. Les acomptes, les avoirs et la TVA à plusieurs taux doivent être gérés. C'est le point où un outil de facturation spécialisé fait gagner du temps.
Stock et achats
Si vous revendez des marchandises, la comptabilité doit suivre les achats et la variation de stock à la clôture. Peu de logiciels comptables gèrent un stock détaillé : il se tient souvent dans un outil de caisse ou de gestion relié à la comptabilité.
TVA et déclarations
Le logiciel calcule la TVA collectée et déductible de la période et prépare la déclaration, mensuelle, trimestrielle ou annuelle selon votre régime. Les erreurs de TVA figurent parmi les premières causes de redressement.
Notes de frais
Plus il y a de personnes qui avancent des frais, plus le rapprochement manuel pèse. Une application mobile qui photographie le justificatif et l'associe à l'opération évite la saisie de fin de mois.
Facture électronique 2026-2027
Selon le calendrier officiel, toutes les entreprises assujetties à la TVA doivent pouvoir recevoir des factures électroniques depuis le 1er septembre 2026, et les PME et TPE devront en émettre à compter du 1er septembre 2027, via une plateforme agréée. Vérifiez que votre éditeur a prévu ce raccordement.
Bilan, liasse et dépôt des comptes
Une société établit chaque année un bilan, un compte de résultat et une liasse fiscale, puis dépose ses comptes selon sa forme juridique. Un entrepreneur individuel a d'autres obligations déclaratives. Un cabinet en ligne s'en charge souvent ; avec un logiciel seul, ces formalités restent à votre charge.
Les fonctionnalités d'un logiciel comptable pour TPE, selon la situation
| Fonctionnalité | Sans salarié | 1 à 3 salariés | 4 à 9 salariés |
| Devis et factures conformes |
Indispensable | Indispensable | Indispensable |
| Synchronisation bancaire |
Indispensable | Indispensable | Indispensable |
| TVA et déclarations |
Indispensablesauf franchise en base | Indispensable | Indispensable |
| Bilan et liasse fiscale |
Indispensable | Indispensable | Indispensable |
| Paie des salariés et DSN |
— | Indispensable | Indispensable |
| Accès multi-utilisateurs |
Utile | Indispensable | Indispensable |
| Suivi de trésorerie et relances |
Utile | Utile | Indispensable |
| Notes de frais |
Utile | Utile | Indispensable |
| Gestion de stock |
Utile | Utile | Utile |
| Facture électronique (plateforme agréée) |
Indispensable | Indispensable | Indispensable |
Forme juridique, employeur, impôt : ce que ça change pour le logiciel
Une TPE peut être exploitée en entreprise individuelle, en EURL, en SARL, en SAS ou sous une autre forme. L'impôt (impôt sur le revenu ou impôt sur les sociétés) et le régime social du dirigeant en dépendent, mais pas l'obligation de tenir une comptabilité : hors micro-régime, elle est tenue selon le régime réel.
L'arrivée du premier salarié change la nature du travail administratif : contrat, bulletins de paie mensuels, DSN, suivi des congés et des absences. Le dirigeant devient employeur, avec des déclarations régulières et des délais à respecter. C'est le moment où beaucoup de TPE basculent d'un logiciel seul vers un cabinet qui prend la paie en charge.
Avec le temps, le rôle de l'expert-comptable évolue : il ne se limite plus au bilan, il aide à piloter la trésorerie, à anticiper la TVA et à préparer les décisions de gestion. Le logiciel sert à produire des chiffres fiables en cours d'année, partagés entre le dirigeant, l'assistante et l'expert.
3 TPE, 3 choix différents
Des profils types, avec des montants annuels estimés.
TPE sans salariéKarim, plombier
Dirigeant seul · devis et factures
- CA annuel
- 90 000 €
- Temps compta / mois
- ~3 h
- Budget outil
- 0 €
Son choix : un outil gratuit pour les devis, les factures et la banque, avec un expert ponctuel pour le bilan. Pas de paie à produire.
TPE avec 1 salariéSophie, boulangère
1 salarié · TVA à plusieurs taux
- CA annuel
- 300 000 €
- Bulletins de paie
- 12 par an
- Budget
- ~80 €/mois
Son choix : un cabinet en ligne avec paie incluse : l'expert cadre le premier bulletin, la TVA et le bilan. L'outil de caisse alimente la comptabilité.
TPE de 5 salariésThomas, agence de communication
5 salariés · assistante · facturation récurrente
- CA annuel
- 600 000 €
- Obligations
- Bilan, paie, TVA
- Budget
- ~200 €/mois
Son choix : un cabinet avec paie et accès multi-utilisateurs : l'assistante saisit, l'expert contrôle, le dirigeant suit la trésorerie.
Combien coûte un logiciel comptable pour une TPE ?
Les prix vont de zéro à plusieurs centaines d'euros par mois, mais ils ne recouvrent pas le même service. Trois familles se distinguent.
- Gratuit : des outils de facturation et de suivi bancaire, suffisants sans salarié. La paie, le bilan et la liasse fiscale sont à faire établir à part.
- De 10 à 40 € par mois : des logiciels comptables complets ou des cabinets en ligne d'entrée de gamme. Vérifiez ce que contient l'offre : paie, nombre d'utilisateurs, bilan et liasse sont parfois en option.
- À partir de 40 € HT par mois : un cabinet d'expertise comptable en ligne, logiciel compris. Le tarif augmente avec le nombre de salariés, de bulletins de paie et d'opérations.
Pour comparer, raisonnez sur douze mois et sur le service complet : un logiciel peu cher auquel s'ajoutent la paie, le bilan et la liasse en prestations séparées peut revenir plus cher qu'un cabinet en ligne qui les inclut. Le simulateur en haut de page calcule ce coût annuel pour votre situation.
Logiciel comptable seul ou expert-comptable en ligne ?
Pour une TPE, la bonne formule évolue avec l'entreprise : le premier salarié et la croissance de la facturation déplacent souvent la frontière.
Logiciel comptable seul
- Sans salarié
- Peu d'opérations
- À l'aise avec la TVA et la liasse
Pour démarrer, un logiciel gratuit ou peu cher suffit si vous tenez vous-même la comptabilité. Tiime en est un exemple.
Logiciel + expert ponctuel
- Saisie faite par vous ou l'assistante
- Expert pour le bilan et la liasse
- Conseil à la demande
Une formule intermédiaire : vous tenez la comptabilité, un expert valide et signe les comptes.
Expert-comptable en ligne
- Un ou plusieurs salariés
- Bilan, liasse et paie pris en charge
- Plusieurs utilisateurs
Un expert-comptable en ligne prend en charge la comptabilité de bout en bout, avec un outil de gestion partenaire (6 mois offerts, puis facturé à part).
Les 6 critères pour bien choisir
- La paie des salariés. Incluse, en option ou à faire ailleurs : le premier point à vérifier dès l'embauche.
- Le nombre d'utilisateurs. Dirigeant, assistante et expert doivent pouvoir accéder au dossier avec des droits adaptés.
- Le suivi de trésorerie. Tableau de bord et relances clients pour anticiper les tensions de trésorerie.
- La TVA et la facture électronique. Calcul, déclaration et plateforme agréée pour 2026-2027.
- Le prix sur 12 mois. Regardez le prix hors promotion et les options (paie, bilan, liasse, utilisateurs).
- L'accompagnement. Un humain joignable au moment de la paie ou de la clôture change tout.
La checklist comptable mensuelle du dirigeant de TPE
- Rapprocher les opérations bancaires et classer chaque dépense
- Établir les bulletins de paie et transmettre la DSN
- Vérifier la TVA collectée et déductible de la période
- Relancer les factures clients impayées
- Contrôler la trésorerie prévisionnelle des trois prochains mois
Questions fréquentes
Quel logiciel comptable choisir pour une TPE ?
Sans salarié, un outil gratuit suffit pour la saisie, complété par un expert pour le bilan. Dès le premier salarié, un cabinet en ligne avec paie incluse est plus sûr. Le critère décisif est le nombre d'utilisateurs et la gestion de la paie, plus que le prix affiché. Le simulateur ci-dessus classe les solutions.
Qu'est-ce qu'une TPE exactement ?
Selon l'Insee, une très petite entreprise emploie moins de 10 personnes et reste sous un plafond de chiffre d'affaires ou de total de bilan. Ce n'est pas une forme juridique : une TPE peut être une entreprise individuelle, une EURL, une SARL ou une SAS. Le seuil sert aux statistiques et à certaines aides.
Quel logiciel pour établir la paie de mon premier salarié ?
Choisissez un outil ou un cabinet qui inclut la paie et la déclaration sociale nominative. Pour un premier salarié, un accompagnement humain réduit le risque d'erreur sur le contrat, les cotisations et les congés. Vérifiez si la paie est comprise dans l'abonnement ou facturée par bulletin avant de vous engager.
Une TPE est-elle obligée d'avoir un expert-comptable ?
Non, la loi ne l'impose pas. Mais une société doit tenir une comptabilité d'engagement, établir un bilan et une liasse fiscale. Beaucoup de dirigeants en confient la production à un expert, surtout avec des salariés. Comparez le coût d'un abonnement avec celui d'un bilan et d'une paie facturés séparément.
La facture électronique concerne-t-elle les TPE ?
Oui. Selon le calendrier officiel, toutes les entreprises assujetties à la TVA doivent pouvoir recevoir des factures électroniques depuis le 1er septembre 2026. Les PME et TPE devront en émettre à partir du 1er septembre 2027, via une plateforme agréée. Demandez à votre éditeur s'il est prêt.
Quand passer d'un logiciel seul à un expert-comptable ?
Plusieurs signaux : premier salarié, TVA complexe, forte hausse du nombre de factures, besoin de prévisions de trésorerie ou de conseil fiscal. Si la comptabilité vous prend plus de quelques heures par semaine, déléguer devient rentable. Un cabinet en ligne permet de garder le logiciel tout en ajoutant l'expert.
Comment nous notons
La note Pepit /5 est une note éditoriale fondée sur 5 critères pondérés selon le métier : statuts couverts, automatisations propres au métier, gestion fiscale, prix sur 12 mois et accompagnement. Elle reflète l'adéquation à votre situation, pas la qualité générale d'un éditeur : un outil moins bien noté ici peut être excellent pour un autre profil. Les tarifs sont relevés sur les sites des éditeurs et mis à jour chaque trimestre ; les avis Google et Trustpilot sont affichés tels quels, avec leur date de relevé.
Sources : service-public.fr, impots.gouv.fr, economie.gouv.fr (facture électronique), insee.fr (définition des TPE), sites éditeurs.
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