Comparatif + simulateur 2026

Logiciel comptable kinésithérapeute : lequel choisir pour votre cabinet ?

Mis à jour le

Kiné seul en micro-BNC, titulaire d'un cabinet équipé en 2035, collaborateur ou associé en SCM : la comptabilité n'est pas la même. Répondez à 5 questions, on vous dit quel outil prendre et combien il vous coûtera sur un an.

Quel logiciel pour votre cabinet de kiné ?

Votre statutLe critère qui élimine le plus de solutions
Votre chiffre d'affaires annuelUne estimation suffit
Ce qui compte pour vousPlusieurs choix possibles
Vous préférez…
  • 4 questions
  • Résultat immédiat
  • Aucune coordonnée demandée
  • ✓6 000 entrepreneurs accompagnés par nos experts-comptables depuis 15 ans.
  • →8 solutions analysées sur les besoins réels d'un kiné libéral : 2035, SESAM-Vitale, banque, TVA.
  • €Tarifs relevés sur les sites éditeurs, offre d'entrée, hors promotions.
  • ★Méthode de notation publique, détaillée en bas de page.
L-Expert-Comptable.comSwapnTiimeContomedKINÉPRATIKTopazeComptasantéAngiilCompta
P Par L'équipe Pepit · Comparatif établi à partir des sites des éditeurs et des données publiques (INSEE, URSSAF).

Vos 3 solutions recommandées

Un doute sur votre situation ? Un expert-comptable Pepit vous répond gratuitement.

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Notre sélection selon votre profil de kinésithérapeute

Il n'y a pas de meilleur logiciel dans l'absolu : tout dépend de votre régime fiscal, de votre matériel, de votre mode d'exercice (seul, collaboration, SCM) et du temps que vous voulez consacrer à la comptabilité.

Meilleur pour démarrer

Kiné qui ouvre son cabinet

1re année · micro-BNC · peu de matériel

Votre CA
20 000 à 50 000 €
Budget
0 €/mois0 € par an
Compatibilité
—

Suivi des encaissements et de la banque sans frais, tant que les charges restent simples.

Limite : Si vous investissez dans du matériel, le micro-BNC ne vous fait rien déduire : comparez avec la 2035.

TiimeGratuit
4,3
Voir Tiime →
Meilleur pour un assistant ou collaborateur

Assistant ou collaborateur libéral

Redevance de collaboration · patientèle partagée

Votre CA
20 000 à 50 000 €
Budget
29 €/mois348 € HT par an
Compatibilité
—

Les comptables suivent la redevance, les frais de véhicule et la 2035 sans que vous y passiez vos soirées.

Limite : Vérifiez que votre contrat de collaboration est bien pris en compte dans l'offre.

Swapndès 29 € HT/mois
4,5
Voir Swapn →
Meilleur pour un titulaire équipé

Titulaire de cabinet

Plateau technique · locaux · amortissements

Votre CA
20 000 à 50 000 €
Budget
39 €/mois468 € HT par an
Compatibilité
—

Immobilisations, amortissements et 2035 suivis par un comptable dédié, avec des conseils fiscaux et juridiques personnalisés.

Limite : Surdimensionné pour un kiné seul avec peu de charges.

L-Expert-Comptable.comdès 39 € HT/mois
4,5
Voir L-Expert-Comptable.com →
Meilleur pour une organisation en groupe

Cabinet de groupe en SCM

Frais communs répartis entre associés

Votre CA
20 000 à 50 000 €
Budget
55 €/mois660 € HT par an
Compatibilité
—

Un cabinet dédié aux soignants libéraux connaît la répartition des frais de SCM et les pratiques propres aux professions de santé.

Limite : Détail des formules à demander ; prix d'entrée plus élevé qu'un logiciel seul.

Comptasantédès 55 € HT/mois
4,1
Voir Comptasanté →

Comparatif complet des logiciels comptables pour kinésithérapeute

SolutionStatutsNote PepitAvisPrix d'entréeDéclaration 2035InclusAccompagnementAction
N°1
L-Expert-Comptable.comCabinet en ligne
MicroEI réelEURL/SARLSASU/SAS
4,5 dès 39 € HT/mois ✓ Oui
BilanLiasseTVAConseil fiscal
Comptable dédié (24 h) Voir →
N°2
SwapnComptabilité en ligne + appli
MicroEI réelEURL/SARLSASU/SAS
4,5 dès 29 € HT/mois ✓ Oui
BilanLiasseTVAFacturation
Équipe comptable (24 h) Voir →
N°3
TiimeLogiciel de gestion
MicroEI réelEURL/SARLSASU/SAS
4,3 Gratuit —
FacturationDevisBanque
Support (tél., mail, chat) Voir →
ContomedCabinet en ligne
MicroEI réelEURL/SARLSASU/SAS
4,2
G 5,0 Google (15 avis)relevé le 06/10/2026
dès 75 € HT/mois —
BNCExpertTVA
Expert dédié Voir →
KINÉPRATIKLogiciel métier
Non précisé
4,1 Tarif non affiché ✓ Oui
FacturationTélétransmissionBNC2035
Logiciel seul Voir →
TopazeLogiciel métier
Non précisé
4,1 dès 35 € HT/mois —
FacturationTélétransmissionAgenda
Logiciel seul Voir →
ComptasantéCabinet en ligne
Non précisé
4,1 dès 55 € HT/mois —
BanqueExpertBNC
Expert dédié Voir →
AngiilComptaLogiciel comptable
MicroEI réelEURL/SARLSASU/SAS
4,0 12 €/mois ✓ Oui
BNC2035Facturation
Logiciel seul Voir →

Tarifs relevés le 05/10/2026 sur les sites éditeurs (offre d'entrée, HT). Note Pepit /5 : voir « Comment nous notons ».

Quel logiciel comptable pour un kinésithérapeute libéral ?

La réponse courte Un kiné libéral relève des bénéfices non commerciaux (BNC). En micro-BNC, un simple suivi des encaissements suffit. En déclaration contrôlée, il faut une comptabilité de trésorerie et la déclaration 2035, avec les amortissements du matériel. Un outil gratuit convient au démarrage ; dès que le cabinet s'équipe ou s'associe, un expert-comptable en ligne est plus sûr.

Le logiciel de gestion du cabinet (SESAM-Vitale, agenda, facturation des actes) et le logiciel comptable sont deux outils différents. Le premier encaisse et télétransmet, le second sert à déclarer votre résultat. Le point d'attention est le lien entre les deux : rapprocher chaque règlement de l'Assurance maladie et des patients avec les lignes de votre compte bancaire.

Les fiches détaillées

Cabinet en ligne
4,5

dès 39 € HT/mois, sans engagement

Idéal pour : Titulaire d'un cabinet en 2035 ou en société (SEL) qui veut tout déléguer

Points forts

  • Comptable dédié, réponse sous 24 h
  • Conseils fiscaux et juridiques personnalisés
  • Sans engagement, création d'entreprise offerte

Limites

  • Micro-entreprise non éligible
  • Outil de gestion partenaire facturé à part après 6 mois offerts
  • Plus cher qu'un logiciel seul
Découvrir L-Expert-Comptable.com →
Comptabilité en ligne + appli
4,5

dès 29 € HT/mois, sans engagement

Idéal pour : Kiné qui veut déléguer sa 2035 à petit prix, seul, en collaboration ou en société

Points forts

  • Bilan et liasse certifiés par un expert-comptable
  • Comptables joignables sous 24 h (tél., visio, chat, e-mail)
  • Sans engagement, facturation électronique conforme

Limites

  • Micro-entreprise non prise en charge
  • Outil de gestion partenaire facturé à part après 6 mois offerts
  • Pas de télétransmission SESAM-Vitale : un logiciel métier reste nécessaire
Découvrir Swapn →
Logiciel de gestion
4,3

Gratuit (Free) ; options dès 9,99 € HT/mois

Idéal pour : Kiné qui démarre, en micro-BNC, et suit lui-même ses encaissements

Points forts

  • Offre gratuite : facturation électronique (plateforme agréée), devis et factures illimités
  • Banque synchronisée et justificatifs automatiques (offres payantes)
  • Support humain par téléphone, mail et chat

Limites

  • Bilan, liasse et déclarations à confier à un expert-comptable
  • Compte pro obligatoire sur les offres payantes
  • Pas d'expert inclus
Découvrir Tiime →
Cabinet en ligne
4,2

dès 75 € HT/mois

G 5,0 Google (15 avis)relevé le 06/10/2026

Idéal pour : Libéral de santé qui veut un expert-comptable 100 % santé

Points forts

  • Cabinet dédié exclusivement aux professions de santé
  • Connaissance URSSAF, CARPIMKO, CARMF
  • Formules 75 € / 85 € HT, devis pour SELARL

Limites

  • Prix d'entrée plus élevé qu'un logiciel seul
Découvrir Contomed →
Logiciel métier
4,1

Tarif non affiché

Idéal pour : Kiné qui veut gestion de cabinet, SESAM-Vitale et compta 2035 dans un seul logiciel

Points forts

  • Comptabilité, grand livre et déclaration 2035 intégrés
  • Télétransmission SESAM-Vitale et NOEMIE
  • Export FEC certifié

Limites

  • Tarifs non publiés sur le site
  • Pas d'expert-comptable inclus
Découvrir KINÉPRATIK →
Logiciel métier
4,1

dès 35 € /mois (29,90 € en offre de rentrée)

Idéal pour : Kiné qui veut facturer SESAM-Vitale avec appli mobile

Points forts

  • Application mobile (4,5 sur les stores)
  • Télétransmission SESAM-Vitale intégrée
  • Tarif dégressif dès le 2e praticien

Limites

  • Détail du module comptable (2035) non précisé sur le site
  • Lecteur de cartes vendu en option
Découvrir Topaze →

Comptasanté

Cabinet en ligne
4,1

dès 55 €/mois

Idéal pour : Praticien de santé libéral qui délègue sa compta à un expert dédié

Points forts

  • Référent comptable dédié, réponse sous 24 h
  • Synchronisation bancaire, tenue quotidienne
  • Plus de 11 000 professionnels accompagnés

Limites

  • Détail des plans non lu sur le site (tarifs sur page dédiée)
Découvrir Comptasanté →

AngiilCompta

Logiciel comptable
4,0

12 €/mois (15 €/mois non-adhérent), base TVA 20 %

Idéal pour : Soignant libéral qui tient sa compta BNC avec accompagnement 2035

Points forts

  • Catégories BNC prévues pour soignants (honoraires, rétrocessions)
  • Calcul automatique des indemnités kilométriques
  • Assistance téléphonique et aide à la 2035 incluses (adhérents)

Limites

  • Pas d'expert-comptable inclus
  • Aide 2035 hors abonnement : 120 € pour les non-adhérents
Découvrir AngiilCompta →

Les fonctionnalités d'un logiciel comptable pour kinésithérapeute

Selon que vous êtes seul en micro-BNC ou titulaire d'un cabinet équipé, les besoins changent. Voici les fonctionnalités à vérifier, et celles qui deviennent indispensables avec la taille du cabinet.

Micro-BNC ou déclaration contrôlée (2035)

Les professions libérales sont soumises au micro-BNC ou à la déclaration contrôlée, selon leurs recettes et leur choix. En micro-BNC, un abattement forfaitaire remplace les charges réelles. En déclaration contrôlée, vous déclarez vos recettes et vos dépenses réelles sur la 2035. Le logiciel doit tenir ce livre de recettes et de dépenses et préparer la déclaration.

Investissements et amortissements

Table, matériel de rééducation, plateau technique, aménagement des locaux : ces achats ne se déduisent pas en une fois mais s'amortissent. Le logiciel doit tenir un tableau d'immobilisations et calculer les dotations. C'est l'un des principaux arguments en faveur de la déclaration contrôlée pour un cabinet bien équipé.

Rapprochement bancaire et télétransmission

Les règlements arrivent de l'Assurance maladie, des mutuelles et des patients, parfois regroupés dans un même virement. Le logiciel de gestion de cabinet télétransmet via SESAM-Vitale et suit les retours. Côté comptabilité, il faut pouvoir rapprocher chaque virement avec les lignes de votre banque, sans resaisie.

Collaboration, assistanat et rétrocessions

En collaboration libérale, le collaborateur reverse une redevance au titulaire, qui est une charge pour l'un et une recette pour l'autre. Les remplaçants rétrocèdent une part d'honoraires. Le logiciel doit permettre de saisir ces mouvements avec la bonne catégorie, car ils pèsent lourd dans la 2035.

SCM, cabinets de groupe et SEL

Dans une société civile de moyens, les frais communs (loyer, secrétariat, matériel) sont refacturés aux associés, qui les déduisent chacun dans leur 2035. Une SEL, elle, a sa propre comptabilité d'engagement, un bilan et une liasse fiscale. Le choix du logiciel dépend de cette structure.

TVA : soins exonérés, prestations hors soins

Les actes de soins réalisés par un kiné dans le cadre de sa profession sont exonérés de TVA. Ce n'est pas le cas de toutes les activités : séances de bien-être sans visée thérapeutique ou vente de produits peuvent être soumises à la TVA. Si vous en proposez, le logiciel doit gérer les deux flux séparément.

Frais de véhicule et soins à domicile

Si vous vous déplacez chez les patients, les frais de véhicule représentent un poste important. Selon votre régime, vous déduisez les frais réels ou un barème kilométrique. Le logiciel doit suivre les trajets et le kilométrage, et vous aider à justifier la méthode retenue.

Cotisations URSSAF et CARPIMKO

Le kiné libéral est affilié à la CARPIMKO pour la retraite et l'invalidité, tandis que l'URSSAF collecte les autres cotisations. Elles sont en partie déductibles du résultat en 2035. Le logiciel doit les catégoriser correctement, car elles s'ajustent selon le revenu de l'année.

Justificatifs et contrôle

Depuis 2025, l'adhésion à une association de gestion agréée n'apporte plus d'avantage fiscal (fin de l'agrément et de la réduction d'impôt associée). Votre logiciel ou votre expert doit surtout classer les justificatifs et produire les documents utiles en cas de contrôle.

Les fonctionnalités d'un logiciel comptable pour kinésithérapeute, selon la situation
FonctionnalitéKiné seul (micro-BNC)Cabinet en 2035Collaboration ou SCM
Suivi des recettes et dépenses IndispensableIndispensableIndispensable
Rapprochement bancaire IndispensableIndispensableIndispensable
Déclaration 2035 —en micro-BNC, pas de 2035IndispensableIndispensable
Immobilisations et amortissements —IndispensableUtileselon la structure
Redevance de collaboration, rétrocessions —UtileIndispensable
Refacturation des frais de SCM ——Indispensable
Suivi des cotisations URSSAF et CARPIMKO UtileIndispensableIndispensable
Frais de véhicule (domicile) UtileIndispensableIndispensable
TVA hors soins Utileseulement si activité hors soinsUtileUtile
Télétransmission SESAM-Vitale Indispensablevia le logiciel métierIndispensableIndispensable

BNC, 2035, SCM : ce que ça change pour le logiciel

Le kiné libéral est imposé dans la catégorie des bénéfices non commerciaux. Deux régimes existent : le micro-BNC, où un abattement forfaitaire remplace les charges réelles, et la déclaration contrôlée, où vous déclarez recettes et dépenses réelles avec la 2035. Le micro-BNC est simple, mais il ne tient pas compte de vos investissements : un cabinet qui achète du matériel ou loue des locaux a souvent intérêt à comparer les deux.

L'exercice en groupe ajoute une couche. En SCM, les frais communs sont partagés mais chacun déclare ses propres recettes. En SEL, la société tient une comptabilité complète, avec bilan et liasse fiscale. En collaboration, la redevance versée au titulaire est une charge pour le collaborateur, et une recette pour le titulaire.

Côté cotisations, l'URSSAF collecte les cotisations sociales et la CARPIMKO la retraite et l'invalidité. Elles s'ajustent sur le revenu réel, avec une régularisation l'année suivante : le logiciel doit donc donner un résultat fiable en cours d'année pour que vous puissiez mettre de côté l'argent nécessaire.

3 kinés, 3 choix différents

Des profils types, avec des montants annuels estimés.

Kiné qui s'installe

Léa, kiné seule

1re année · micro-BNC · peu de matériel
Recettes annuelles
55 000 €
Temps compta / mois
~2 h
Budget outil
0 €
Son choix : un outil gratuit pour suivre les encaissements et la banque, avec un point annuel avec un expert pour vérifier que le micro-BNC reste le bon choix.
Collaborateur libéral

Karim, collaborateur

Redevance de collaboration · soins à domicile
Recettes annuelles
75 000 €
Redevance
~25 % des recettes
Budget
~35 €/mois
Son choix : un cabinet en ligne qui suit la 2035, la redevance de collaboration et les frais de véhicule, sans que Karim ait à jongler avec la fiscalité.
Titulaire équipé

Sophie, cabinet de groupe

SCM de 3 associés · plateau technique
Recettes annuelles
110 000 €
Investissements
~30 000 €
Budget
~85 €/mois
Son choix : un expert-comptable dédié aux soignants : amortissements du matériel, refacturation des frais de SCM et 2035, avec une visibilité sur les cotisations.

Combien coûte un logiciel comptable pour un kinésithérapeute ?

Les prix vont de zéro à une centaine d'euros par mois, pour des services différents. Trois familles se distinguent.

  • Gratuit : des outils de facturation et de suivi bancaire, suffisants pour un kiné en micro-BNC. La 2035 et les amortissements restent à faire faire.
  • Quelques dizaines d'euros par mois : un logiciel comptable complet ou un cabinet en ligne d'entrée de gamme, avec une assistance à la 2035. Vérifiez ce que contient l'offre.
  • Plus élevé : un expert-comptable spécialisé dans les professions de santé, ou un cabinet en ligne avec expert dédié. L'expert établit la 2035, suit les amortissements et vous conseille sur la structure.

Pour comparer, raisonnez sur douze mois et sur le service complet, en incluant le logiciel de gestion de cabinet qui reste souvent nécessaire pour SESAM-Vitale. Le simulateur calcule ce coût annuel pour votre situation.

Logiciel comptable seul ou expert-comptable en ligne ?

Pour un kiné, la question est autant celle de la 2035 que de l'outil.

Logiciel de gestion avec comptabilité

  • Kiné seul, peu de charges
  • Compta intégrée au logiciel métier
  • À l'aise avec la 2035

Pour comparer, voir cet article sur les meilleurs logiciels comptables pour un kiné.

Logiciel + expert ponctuel

  • Saisie faite par vous
  • Expert pour la 2035
  • Conseil sur le régime fiscal

Une formule intermédiaire : vous suivez les encaissements, un expert établit la déclaration.

Expert-comptable en ligne

  • Cabinet équipé, collaboration ou SCM
  • 2035 et amortissements pris en charge
  • Conseil sur la structure (SEL, SCM)

Un expert-comptable en ligne pour kiné prend en charge la comptabilité de bout en bout.

Les 6 critères pour bien choisir

  1. La déclaration 2035 prise en charge. Incluse, en option ou à faire ailleurs : c'est le premier point à vérifier.
  2. Les amortissements. Un tableau d'immobilisations fiable si vous investissez dans le matériel.
  3. Le lien avec le logiciel métier. Export des écritures ou saisie simplifiée des règlements SESAM-Vitale.
  4. Collaboration et SCM. Catégories adaptées aux redevances, rétrocessions et frais refacturés.
  5. Le prix sur 12 mois. Regardez le prix hors promotion et les options (2035).
  6. L'accompagnement. Un humain qui connaît les professions de santé au moment de la déclaration.

La checklist comptable mensuelle du kinésithérapeute

  • Rapprocher les virements de l'Assurance maladie, des mutuelles et des patients avec la banque
  • Classer chaque dépense (loyer, matériel, véhicule) et joindre le justificatif
  • Noter les kilomètres des soins à domicile
  • Mettre à jour le tableau des immobilisations après chaque achat de matériel
  • Vérifier les prélèvements URSSAF et CARPIMKO et provisionner la régularisation

Questions fréquentes

Quel logiciel comptable choisir pour un kinésithérapeute ?

En micro-BNC et sans matériel lourd, un outil gratuit suffit pour suivre les encaissements. En déclaration contrôlée avec un cabinet équipé, mieux vaut un logiciel ou un cabinet en ligne qui prend en charge la 2035 et les amortissements. Le simulateur ci-dessus classe les solutions selon vos besoins.

Faut-il choisir le micro-BNC ou la déclaration contrôlée ?

Le micro-BNC applique un abattement forfaitaire et simplifie la comptabilité. La déclaration contrôlée déduit vos charges réelles. Si vous investissez dans du matériel, louez des locaux ou avez des frais de véhicule importants, la déclaration contrôlée est souvent plus avantageuse. Faites une simulation avec un expert avant de choisir.

Le logiciel SESAM-Vitale remplace-t-il un logiciel comptable ?

Non. Le logiciel de gestion de cabinet facture les actes et les télétransmet, mais il ne remplace pas la comptabilité. Certains incluent un module de suivi des recettes et dépenses, parfois la 2035. Vérifiez que vous pouvez rapprocher les règlements avec votre banque et exporter vos écritures.

Comment comptabiliser une redevance de collaboration ?

Pour le collaborateur, la redevance versée au titulaire est une charge professionnelle, déductible en déclaration contrôlée. Pour le titulaire, c'est une recette à déclarer. Le contrat de collaboration doit fixer la redevance. Demandez à votre expert-comptable de vérifier le traitement avec votre contrat.

Un kiné est-il soumis à la TVA ?

Les actes de soins réalisés dans le cadre de la profession sont exonérés de TVA. En revanche, des prestations sans visée thérapeutique, comme du bien-être, ou la vente de produits peuvent y être soumises. Si vous proposez ce type d'activité, faites vérifier votre situation par un expert.

Quelle caisse de retraite pour un kinésithérapeute libéral ?

Le kiné libéral est affilié à la CARPIMKO pour la retraite et l'invalidité-décès. Les autres cotisations sociales sont collectées par l'URSSAF. Les cotisations dépendent du revenu et font l'objet d'une régularisation l'année suivante. Votre logiciel doit les distinguer pour que votre résultat soit fiable.

Comment nous notons

La note Pepit /5 est une note éditoriale fondée sur 5 critères pondérés selon le métier : statuts couverts, automatisations propres au métier, gestion fiscale, prix sur 12 mois et accompagnement. Elle reflète l'adéquation à votre situation, pas la qualité générale d'un éditeur : un outil moins bien noté ici peut être excellent pour un autre profil. Les tarifs sont relevés sur les sites des éditeurs et mis à jour chaque trimestre ; les avis Google et Trustpilot sont affichés tels quels, avec leur date de relevé.

Sources : service-public.gouv.fr, impots.gouv.fr (BOFiP, TVA), ameli.fr, urssaf.fr, sites éditeurs.

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